蒼蠅的食性非常復雜，屬于雜食性蠅類，可以取食各種物質，如人的食物、人和畜禽的分泌物和排泄物、廚房殘渣和其他垃圾以及植物的液汁等。家蠅飽食之后，間隔很短時間（幾分鐘），即可排糞。由于吐瀉、排糞頻繁，失水較多，又促使其頻繁取食，因而蒼蠅在孳生物質上邊吃、邊吐、邊排，造成嚴重污染。在畜禽場里，飼料及飲水器具常被其污染。

蒼蠅能夠傳播 50 種疾病，其中對畜禽養殖有影響的重要疾病如禽流感、新城疫、口蹄疫、豬瘟、禽多殺性巴氏桿菌病、禽大腸桿菌病，球蟲病等，在疾病暴發時蒼蠅可加速流行性疫病的傳播。畜禽舍內的大量蒼蠅，可導致禽群煩躁不安，污染蛋殼。糞便中蛆的活動可導致禽舍內的氨氣含量升高，影響雞群的生產性能，還可導致家畜精神不安，畜群身體相互磨擦，相互撕咬等造成外表的損傷，降低了肉用等級。畜禽的精神狀態不佳和過多的運動會降低肉料比，增加了飼養成本，降低受益。另外，蒼蠅還可以傳播多種人類的傳染疾病，從而威脅從業人員的身體健康。